中石油集團一位內部人士表示，除了增加企業一些不必要的開銷外，在生產環節繳稅還有另一個問題：一些走私油可能會因現有的征收體系而變得更有“市場競爭力”。
既然是走私，這類油品就不會走正常的關稅渠道。每噸走私汽油、柴油會直接少交1388元、952元左右的消費稅。當走私商人把這些不含稅的產品以較低價賣給批發商、加油站之后，批零企業又是以國家規定的正常批零價格賣出去，顯然會賺取更多的利潤，這既不合理也不合法，對其他批零企業而言也有失公平。
廈門大學教授林伯強指出，“如果政府從批發環節來征收消費稅，買走私油和買正規渠道的成品油對于批發商來說，就沒有什么區別了。因為即便走私逃了稅，但是批發商也要交消費稅的。屆時很多批發商可能會傾向于選擇正常渠道、更加有保證的汽柴油，走私油會流失大量客戶。”
此外，在生產環節征收汽柴油消費稅，對部分出口汽柴油、來料加工的煉廠來說也不利。
中石油人士指出，國內部分煉廠使用原油、石腦油等產品作為原材料生產汽柴油，煉廠同樣需要在這種情形下交納消費稅。但是，煉廠無法把國家已征收的這部分消費稅，從出口客戶、來料加工的客戶那里拿回來，等于說，這部分消費稅由生產商承擔了。
除上述原因外，一些地方煉廠也對于目前的征稅體系感到負擔很重。不少地煉都在使用進口燃料油來作為原料、再加工成為汽柴油。因此，將出現政府對進口燃料油、生產汽柴油這兩個環節中“雙重”征稅的情況。
一位不愿意透露姓名的券商研究員指出，短期看國家還不會取消生產環節征稅的方式，一是其他環節征稅涉及主體較多，而生產環節征收簡便易行，也不容易大量漏稅。
二是如果改為批發或零售環節征稅的話，一些設施建設還需要完善，比如在零售加油站環節征稅，需要增加或者更新一些稅控機。
